Si te pagan con un cheque tenes que elegir la cuenta "cheques de terceros" y en la observación de la cobranza podes poner el nro de cheque, la fecha de depósito y todos los datos que creas relevante
Este movimiento va a aumentar el saldo de tu cartera de cheques, podes entrar a mirar el detalle en Tesorería

Cuando deposites el cheque deberías hacer un movimiento entre cuentas, en donde la cuenta de salida es "cheques de terceros" y la cuenta de entrada es "banco" por el valor del cheque

Si le pagas a un proveedor con un cheque propio tenes que elegir la cuenta "cheques propios" y en la observación del pago podes poner el nro de cheque, la fecha de pago y todos los datos que creas relevante
Este movimiento va a aumentar el saldo de la cuenta "Cheques Propios", podes entrar a mirar el detalle en Tesorería

Cuando tu proveedor deposite el cheque deberías hacer un movimiento entre cuentas, en donde la cuenta de salida es "banco" y la cuenta de entrada es "cheques propios" por el valor del cheque